Khử trùng trong phòng sạch có nghĩa là tiêu diệt hoặc loại bỏ tất cả các vi sinh vật (bao gồm cả vi khuẩn, vi rút, v.v.) trong một chất, có ý nghĩa tuyệt đối. Nói cách khác, tương ứng với tiệt trùng là không tiệt trùng, và không có trạng thái trung gian là khử trùng nhiều hơn và khử trùng ít hơn. Theo quan điểm này, tiệt trùng tuyệt đối gần như không tồn tại vì khó đạt được hoặc đạt đến thời gian vô hạn.
Các phương pháp tiệt trùng thường được sử dụng chủ yếu bao gồm: tiệt trùng sấy khô ở nhiệt độ cao, khử trùng bằng hơi nước áp suất cao, khử trùng bằng khí, khử trùng bằng bộ lọc, khử trùng bằng bức xạ, v.v.